肠道外感染主要是由于病原体毒素的影响或神经系统发育不健全，致使消化系统功能紊乱、肠蠕动增加而引起腹泻。尤其是新生宝宝患中耳炎、上呼吸道感染、肺炎、泌尿系感染、皮肤感染、败血症等急性传染病时，细菌从肠道外或血液中透过肠壁，渗入到肠道内，引起肠炎，导致腹泻。
肠道内感染性腹泻大多属中轻度腹泻。患此类腹泻的宝宝每日便便次数多在10次以下，极少数可达十几次，每次大便量不多，稀薄或带水，呈黄色、或微黄色，有酸味，常见白色或黄白色奶瓣(皂块)和泡沫，并混有少量黏液。患病宝宝会显得食欲不振，微有发热(38℃以下)，但并无脱水等明显全身症状。只要治疗及时，多可在数日内痊愈。
肠道外感染性腹泻多由于新生宝宝患中耳炎、肺炎、皮肤感染、败血症等急性传染病后，引起病毒入侵导致的并发性腹泻
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